Abstract The purpose of this review was to describe how adaptive laboratory evolution (ALE) can provide improvement to lactic acid bacteria (LAB) strains for their application in industrial biotechnological processes. This review was carried out according to the Preferred Reporting Items for Systematic Review and Meta-analysis (PRISMA) approach, incorporating the ScienceDirect and Scopus databases. The literature search yielded 4,167 (ScienceDirect) and 27 (Scopus) articles, which were reduced to 12 after applying the inclusion /exclusion criteria. The studies revolved around LAB of the genera Lactobacillus, Lactococcus, Leuconostoc and Enterococcus and the application of ALE experiments in batch mode, fed-batch mode, or both, and aimed to produce strains with increased lactic acid production capabilities, higher cell viability, and multiple-stress tolerance. The studies demonstrated that ALE is an efficient approach for strain modification towards desired phenotypic functions and does not require genetic engineering. Knowledge of the cellular and molecular responses of microorganisms to stress enables an understanding of the adaptation mechanisms of LAB strains for survival and increased production of metabolites throughout ALE experiments.

Resumo O objetivo deste artigo de revisão foi descrever como a adaptação laboratorial evolutiva (ALE) pode proporcionar o melhoramento de cepas de bactérias ácido-lácticas (BAL) para aplicação em processos biotecnológicos industriais. A revisão foi realizada de acordo com a abordagem Preferred Reporting Items for Systematic Review and Meta-analysis (PRISMA), empregando as bases de dados ScienceDirect e Scopus. A busca bibliográfica resultou em 4.167 e 27 documentos, respectivamente, os quais reduziram-se para 12 após a aplicação dos critérios de inclusão/exclusão. Os trabalhos utilizaram BAL dos gêneros Lactobacillus, Lactococcus, Leuconostoc e Enterococcus para a ALE, empregando o método batelada ou batelada alimentada ou ambos, e tinham como objetivo a geração de cepas com maior capacidade de produção de ácido láctico, viabilidade celular e tolerância a diferentes condições de estresse. Os estudos demonstraram que a ALE é uma ferramenta eficiente no melhoramento de cepas para os fenótipos desejados, além de não empregar engenharia genética. O conhecimento das respostas celulares e moleculares dos microrganismos ao estresse possibilita a compreensão dos mecanismos de adaptação das cepas de BAL para sobrevivência e maior produção de metabólitos ao longo da ALE.

The yeasts of the genus Candida infect skin, nails, and mucous membranes of the gastrointestinal and the genitourinary tract. The aim of this study was to determine the prevalence of dermatomycoses caused by Candida spp., and their etiological aspects in the metropolitan area of Porto Alegre, Brazil. A retrospective study with data obtained from tertiary hospital patients, from 1996 to 2011, was performed. The analyzed parameters were date, age, gender, ethnicity, anatomical region of lesions, and the direct examination results. For all the statistical analyses, a = 0.05 was considered. Among positive results in the direct mycological examination, 12.5% of the total of 4,815 cases were positive for Candida spp. The angular coefficient (B) was -0.7%/ year, showing a decrease over the years. The genus Candida was more prevalent in women (15.9% of women versus 5.84% of men), and in addition, women were older than men (54 versus 47 years old, respectively). There was no difference between ethnic groups. The nails were more affected than the skin, with 80.37% of the infections in the nails (72.9% in fingernails and 7.47% in toenails). Our study corroborates the literature regarding the preference for gender, age, and place of injury. Moreover, we found a decrease in infection over the studied period.

RESUMO Pitiríase versicolor é a mais comum das doenças causadas pelas leveduras do gênero Malassezia. O objetivo do trabalho foi determinar a prevalência de pitiríase versicolor e seus aspectos etiológicos na região metropolitana de Porto Alegre, Brasil. Foi realizado um estudo retrospectivo transversal com dados de pacientes de hospital de referência entre 1996 a 2011. Os dados coletados foram: data, idade, gênero, etnia, local anatômico da lesão e resultados do exame micológico direto. Dentre os resultados positivos do exame micológico direto, 5,8% (2.239) foram positivos para pitiríase versicolor. O coeficiente angular (B) foi -0,3%/ ano, mostrando uma diminuição ao longo dos anos. A doença foi mais prevalente em homens (7,1% dos homens versus 5,1% das mulheres que se submeteram ao exame micológico direto); jovens (mediana de 31 anos); pardos e pretos (3,7% acima do esperado para a amostra); tronco (73,4% dos locais anatômicos afetados). Lesões em locais raros (virilha, genitálias, pernas, pés e mãos) também foram observadas no estudo. Em conclusão, devido à diminuição da prevalência de pitiríase versicolor, estudos epidemiológicos de longo prazo são necessários para continuar o monitoramento da doença na região metropolitana de Porto Alegre, Brasil.

SUMMARY Pityriasis versicolor is the most common of the diseases caused by Malasseziayeasts. The aim of this study is to determine the prevalence of pityriasis versicolor and its etiological aspects in the metropolitan area of Porto Alegre, Brazil. A retrospective crosssectional study with data from patients of a reference hospital from 1996 to 2011 was performed. Collected data included: date, age, gender, ethnicity, anatomical region of lesion and the direct mycological examination results. Among the positive results in the direct mycological examination, 5.8% (2,239) were positive for pityriasis versicolor. The angular coefficient (B) was -0.3%/year, showing a decrease over the years. The disease was more prevalent in men (7.1% of men versus 5.1% of women that underwent the direct mycological examination); younger age (median 31 years old); "pardo" and black people (3.7% more than expected in the sample); trunk (73.44% of the affected anatomic sites). Lesions in rare sites (groin, genitals, legs, feet and hands) were also observed in this study. In conclusion, due to the decrease in the prevalence of pityriasis versicolor, long-term epidemiological studies in the metropolitan area of Porto Alegre, Brazil, are needed to continue the monitoring of this disease.

FUNDAMENTOS: A metodologia padronizada para a determinação da sensibilidade aos antifúngicos frente ao complexo Sporothrix schenckii preconiza a utilização do meio de cultura Roswell Park Memorial Institute (RPMI) 1640 tamponado com ácido morfolinopropanosulfônico (MOPS). No entanto, este meio possui custo elevado, execução trabalhosa e esterilização por filtração. Já o caldo Sabouraud-dextrose é amplamente utilizado em micologia, de baixo custo e pode ser esterilizado por autoclavagem. OBJETIVO: Avaliar o desempenho do meio de cultura caldo Sabouraud-dextrose em substituição ao RPMI 1640-MOPS na determinação da sensibilidade de S. schenckii a antifúngicos. MÉTODO: Foram avaliados 48 isolados clínicos frente a cinco antifúngicos: itraconazol, cetoconazol, fluconazol, anfotericina B e terbinafina, utilizando a metodologia da microdiluição em caldo preconizada pelo protocolo M38-A2 do Clinical and Laboratory Standards Institute. RESULTADOS: Não houve diferenças significativas nas Concentrações Inibitórias Mínimas obtidas nos dois meios de cultura para todos os antifúngicos, com exceção da anfotericina B. Para este fármaco, foram obtidas faixas mais amplas de Concentrações Inibitórias Mínimas para caldo Sabouraud-dextrose do que para Roswell Park Memorial Institute-morfolinopropanosulfônico. CONCLUSÕES: O caldo Sabouraud-dextrose mostrou potencial para ser utilizado na avaliação in vitro da atividade antifúngica do complexo S. schenckii.

BACKGROUND: The standard methodology for determining the antifungal sensitivity against the Sporothrix schenckii complex recommends the use of the 1640 Roswell Park Memorial Institute culture medium (RPMI) buffered with morpholinepropanolsulfonic acid (MOPS). However, while this is a high-cost medium which requires a laborious implementation and sterilization by filtration, the Sabouraud dextrose broth is a low-cost medium, widely used in mycology, sterilized by autoclave. OBJECTIVE: To evaluate the performance of the Sabouraud dextrose broth culture medium as a substitute for the RPMI 1640-MOPS in determining the antifungal sensitivity of S. schenckii. METHODS: Forty-eight clinical isolates were evaluated against five antifungal agents: itraconazole, ketoconazole, fluconazole, amphotericin B and terbinafine, using the method of broth microdilution advocated by the M38-A2 protocol of the Clinical and Laboratory Standards Institute. RESULTS: There were no significant differences between the Minimum Inhibitory Concentrations obtained in the two culture media for all the antifungals, with the exception of the amphotericin B. Regarding this drug, the Minimum Inhibitory Concentration range obtained were wider for the Sabouraud dextrose broth than for the Roswell Park Memorial Institute morpholinepropanelsulfonic acid. CONCLUSIONS: The Sabouraud dextrose broth showed potential to be used in the in vitro evaluation of the S. schenckii complex antifungal activity.

A esporotricose é uma infecção subaguda ou crônica, causada por fungos pertencentes ao Complexo Sporothrix. Relato do caso: esporotricose de localização nasal foi tratada com iodeto de potássio e como não se obteve sucesso, reiniciou-se o tratamento com associação de iodeto de potássio e itraconazol. Porém, ocorreu nova recidiva. As culturas dos exames micológicos foram submetidas a ensaios de atividade antifúngica in vitro para auxiliar no tratamento. A terbinafina foi o antifúngico que apresentou melhores resultados, por isso, o tratamento foi reiniciado com este antifúngico e, após dois anos do término do mesmo, não recidivou. Adicionalmente, ambas as culturas foram comparadas por RAPD, obtendo padrões de fragmentos distintos, indicando que os isolados são diferentes ou demonstrando um processo microevolutivo do microrganismo

Sporotrichosis is a chronic subacute infection caused by fungi belonging to the Sporothrix Complex. In the present clinical case, nasal sporotrichosis was treated with potassium iodide. This was unsuccessful, and the treatment was restarted with a combination of potassium iodide and itraconazole. This however resulted in a further recurrence of the infection. The mycological cultures were tested in vitro for antifungal activity to assist in treatment. Terbinafine, an antifungal drug, produced the best results and was therefore used for the rest of the treatment course, with no recurrence after two years of its completion. In addition, both cultures were compared using RAPD and different fragment patterns were observed. This indicated that the isolates were either different or indicated a microevolutionary process of this microorganism

FUNDAMENTOS: As dermatofitoses apresentam alta prevalência na população em geral e, principalmente, em pacientes com insuficiência renal crônica, necessitando tratamento com antifúngicos tópicos e/ou sistêmicos, cuja eficácia precisa ser avaliada. Estudos in vitro para avaliar a ação de antifúngicos são raros, especialmente, em fungos filamentosos. OBJETIVO: Avaliar o perfil de suscetibilidade de diferentes espécies de dermatófitos, isolados de pacientes com insuficiência renal crônica, em relação a nove antifúngicos disponíveis comercialmente para o tratamento de dermatofitoses. MÉTODO: Analisaram-se 26 isolados de dermatófitos de pacientes com insuficiência renal crônica em relação a nove antifúngicos (cetoconazol, ciclopirox olamina, fluconazol, griseofulvina, itraconazol, miconazol, piroctona olamina, terbinafina e tioconazol) pelo método de microdiluição em caldo proposto pelo Clinical and Laboratory Standards Institute (CLSI), com modificações para dermatófitos. RESULTADOS: Entre os antifúngicos testados, a terbinafina e o tioconazol obtiveram os melhores resultados de sensibilidade e o fluconazol apresentou baixa atividade, especialmente para as amostras da espécie M. gypseum. O ciclopirox olamina, apesar de menos eficaz que a terbinafina, também mostrou resultados satisfatórios. CONCLUSÕES: De modo geral, o perfil de sensibilidade dos antimicóticos testados seguiu o padrão de resultados mostrados por estudos anteriores, ratificando a necessidade de conhecimento da espécie causadora de dermatofitose, devido à variação do perfil de suscetibilidade entre as espécies. Além disso, nossos resultados demonstram a importância da realização de ensaios de sensibilidade in vitro, pois alguns isolados da mesma espécie apresentaram diferente perfil de sensibilidade

BACKGROUND: The prevalence of dermatophytosis in the general population is high, particularly in patients with chronic renal failure. Treatment requires the use of topical and/or systemic antifungal drugs. The efficacy of antifungal agents for the treatment of dermatophytosis has yet to be evaluated. Studies evaluating the in vitro activity of antifungal agents are rare, particularly in filamentous fungi. OBJECTIVE: To evaluate the susceptibility profile of different species of dermatophytes isolated from patients with chronic renal failure to nine antifungal drugs available on the market for the treatment of dermatophytosis. METHODS: Twenty-six isolates of dermatophytes obtained from patients with chronic renal failure were analyzed with respect to their susceptibility to nine antifungal agents (ketoconazole, ciclopirox olamine, fluconazole, griseofulvin, itraconazole, miconazole, piroctone olamine, terbinafine and tioconazole), using the broth microdilution method proposed by the Clinical and Laboratory Standards Institute (CLSI) and adapted for dermatophytes. RESULTS: Of the antifungal agents tested, the best results in terms of sensitivity were found with terbinafine and tioconazole, while the antifungal activity of fluconazole was found to be weak, particularly against strains of M. gypseum. Ciclopirox olamine, although less effective than terbinafine, also yielded satisfactory results. CONCLUSIONS: In general, the sensitivity profile of the antifungal agents tested in this study was similar to results obtained in previous studies, confirming the need to determine which species is causing the dermatophytosis given that antifungal susceptibility varies from one species to another. Furthermore, the present findings show the importance of conducting in vitro sensitivity tests, since the sensitivity profile may differ among isolates of the same species